הבדיקה בוחנת את הרכב רחב של חיידקיי המעיים (מיקרו-ביום, micro-biome) .בנוסף לבדיקת תרבית המאפשרת לזהות את החיידקים ידידותיים\פרזיטים אחרים באמצעות המיקרוסקופ, בבדיקת הצואה מקיפה משתמשים בטכנולוגיית ה-qPCR. אשר מזהה את אוכלוסיית החיידקים אשר לא נמצאו תחת זכוכית מוגדלת, אלא ע"י עקבותיהם הגנטיים.

בבדיקה מופיעה אארובית אנאירובית \ פיזיולוגית, כמו Bacteroides ,Bifidobacteria , Lactobacilli , Clostridia spp., E. coli , Enterobacteriaceae , Enterococci. החיידקים האחראים על מצב של דיסביאוזה, dysbiosis – הפרת המאזן של חיידקים: E. coli – mucous, E.coli – Lak. Neg, Pseudomonas spp, Pseud. aeruginosa, Staphylococci , Streptococci. כמו כן, ניתן לזהות חיידקים פתוגניים המעורבים בהתפתחות מחלות זיהומיות: Salmonella ,Yersinia, Shigella, Campylobacter.

לגרות תגובות אוטו-אימוניות: Citrobacter freundii , Proteus mirabilis , Proteus spp.. פרזיטים חמורים, כמו ג'ארדיה (Giardia ), Entamoeba histolytica, Blastocystis hominis , Clostridium difficille . חיידקים המייצרים את היסטמין:Klebsiella pneumoniae , Morganella spp.. הליקובקטר פילורי (H.Pylori) פטריות ועובש, כולל קנדידה ועוד.